水生態修復一般分為人工修復、自然修復兩類。生態缺損較大的區域，以人工修復為主，并與自然修復相結合，以人工修復促進自然修復;現狀生態較好的區域，以保護和自然修復為主，人工修復主要是為自然修復創造更良好環境，加快生態修復進程，促進穩定化過程。

水生態修復技術包括“控源減污、基礎生境改善、生態修復和重建、優化群落結構”四項技術措施。水體生態修復不僅包括開發、設計、建立和維持新的生態系統，還包括生態恢復、生態更新、生態控制等內容，同時充分利用水調度手段，使人與環境、生物與環境、社會經濟發展與資源環境達到持續的協調統一。

其中生態修復和重建應注意以下幾點:
①種植水生植物要選擇適合的種類和品種并合理搭配;
②生態修復要選擇適當的時機;
③生態修復要創造適宜的生物生長環境;
④合理養殖水生動物;
⑤提倡鄉土品種，防止外來有害物種對本地生態系統的侵害;
⑥優化群落結構。